Published journal articles indexed by SCI, SSCI, and AHCI
The effect of pre-pregnancy obesity on gut and meconium microbiome and relationship with fetal growth
Journal of Maternal-Fetal and Neonatal Medicine
, vol.35, no.26, pp.10629-10637, 2022 (SCI-Expanded)




Pulsed-field gel electrophoresis characterization of Bordetella pertussis clinical isolates circulating in Turkey in 2001-2009.
European journal of clinical microbiology & infectious diseases : official publication of the European Society of Clinical Microbiology
, vol.30, pp.1229-36, 2011 (SCI-Expanded)


Genetic diversity and major spoligotype families of drug-resistant Mycobacterium tuberculosis clinical isolates from different regions of Turkey.
Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases
, vol.7, pp.513-9, 2007 (SCI-Expanded)



Articles Published in Other Journals
Moleküler Epidemiyoloji: Tanımı Ve Kullanım Alanları (Molecular Epidemiology: Definition And Usage Areas)
GEVHER NESIBE JOURNAL OF MEDICAL & HEALTH SCIENCES
, vol.7, no.16, pp.46-48, 2022 (Peer-Reviewed Journal)

Pulsed-Field Gel Electrophoresis (PFGE) standardization protocol for Proteus mirabilis
J Clin Exp Invest
, 2013 (Peer-Reviewed Journal)
Role of IL-2, IL-4 and IL-10 in patients infected with Giardia lamblia.
Turkiye parazitolojii dergisi
, vol.29, pp.160-2, 2005 (Peer-Reviewed Journal)

Th1 and Th2 inducing cytokines in Cystic echinococcosis.
Turkiye parazitolojii dergisi
, vol.29, pp.167-70, 2005 (Peer-Reviewed Journal)

Tüberkülozun tanısında polimeraz zincir reaksiyon yönteminin değeri: Dört yıllık sonuçların karşılaştırılması
İnfeksiyon Dergisi / Turkish Journal of Infection
, vol.14, no.2, pp.193-196, 2000 (Peer-Reviewed Journal)
Histopathologic and immunohistochemical analyses of Hodgkin’xx s disease and the correlation with Epstein-Barr virus
Turkish Journal of Cancer
, vol.29, no.3, pp.101-109, 1999 (Peer-Reviewed Journal)
İdrar kültürlerinde üreyen novobiosine duyarlı koagulaz negatif stafilokoklar: Kontaminasyon mu, gerçek patojen mi?
İnönü Üniversitesi Turgut Özal Tıp Merkezi Dergisi
, vol.6, no.3, pp.225-228, 1999 (Peer-Reviewed Journal)
Refereed Congress / Symposium Publications in Proceedings
KARBAPENEM DİRENÇLİ ACINETOBACTER BAUMANNII KAN İZOLATLARININ MOLEKÜLER KARAKTERİZASYONU: MULTİLOCUS SEQUENCE TYPING, PULSOTYPING VE DİRENÇ İLİŞKİLİ MUTASYON ANALİZİ
5. ULUSAL KLİNİK MİKROBİYOLOJİ KONGRESİ, İzmir, Turkey, 28 October - 01 November 2019, pp.261
Tüberkülozun Tanı ve Kontrolünde Laboratuvarın Rolü
Buhasder Kongresi 2019, Turkey, 16 - 20 October 2019
The Results of Smoking on Oral Microbiome and Health
Natural Nutrition, Healthy Life and Sport’, 2 - 06 October 2019

Karbapenem direncli Klebsiella pneumoniae izolatlarında karbapenem direnç mekanizmalarının değerlendirilmesi ve mcr-1geninin araştırılması
XXXVIII. Türk Mikrobiyoloji Kongresi, Antalya, Turkey, 4 - 08 November 2018
DÜNDEN BUGÜNE MOLEKÜLERTİPLENDİRME YÖNTEMLERİ
XXXVIII th Turkish Microbiology Congress, 4 - 08 November 2018
ANALYSIS OF THE EFFECT OF SMOKING IN ORALMICROBIOME USING THE NEXT GENERATIONSEQUENCING TECHNOLOGY
XXXVIII th Turkish Microbiology Congress, 4 - 08 November 2018
KARBAPENEM DİRENÇLİ KLEBSİELLA PNEUMONİAEİZOLATLARINDA KARBAPENEM DİRENÇMEKANİZMALARININ DEĞERLENDİRİLMESİ VE MCR-1GENİNİN ARAŞTIRILMASI
XXXVIII th Turkish Microbiology Congress, 4 - 08 November 2018
BRUSELLOZUN TANISINDA KULLANILABİLECEKGERÇEK ZAMANLI POLİMERAZ ZİNCİR REAKSİYONYÖNTEMİNİN OPTİMİZASYON VE VALİDASYONÇALIŞMALARI
XXXVIII th Turkish Microbiology Congress, 4 - 08 November 2018
PHYLOGENETİC ANALYSİS OF VP7 AND VP4 GENES OFTHE COMMON ROTAVİRUS A GENOTYPES CİRCULATİNGİN TURKEY FROM 2013 TO 2016
XXXVIII th Turkish Microbiology Society, 4 - 08 November 2018
QUALITATIVE ANALYSIS OF MOST COMMONARCHAEA IN HUMAN ORAL MICROBIOTA BASED ONPCR AMPLIFICATION
XXXVIII Turkish Microbiology Congress, 4 - 08 November 2018
Sarımsak türevlerin (S-Alkilserkaptosistein, Dialil Disülfid ve S-Allilsistein) Kulak Enfeksiyonlarından Yaygın Olarak İzole Edilen Mikroorganizmalar Üzerine Antimikrobiyal Etkisi.
Uluslararası Avrasya Doğal Beslenme ve Sağlıklı Yaşam Zirvesi, 12 - 15 July 2018
Sarımsak türevlerin (S-Alkilserkaptosistein, Dialil Disülfid ve S-Allilsistein) Kulak Enfeksiyonlarından Yaygın Olarak İzole Edilen Mikroorganizmalar Üzerine Antimikrobiyal Etkisi.
Uluslararası Avrasya Doğal Beslenme ve Sağlıklı Yaşam Zirvesi, Ankara, Turkey, 12 - 15 July 2018, vol.1, pp.910
Candida albicans isolates with resistant/reduced susceptibility (non-WT) to fluconasole by DNA sequencing
28th ECCMID, 21 - 24 April 2018
Evaluation of two-year blood culture profiles in a tertiary Hospital in turkey: microorgansims and their antimicrobial Susceptibility patterns.
10.Balkan Congress of Microbiology, 16 - 18 November 2017
Investigation of cross-transmission dynamics of brucellosis observed in children in the province of Diyarbakir and phylogenetic tree of the brucella isolates
10.Balkan Congress of Microbiology, 16 - 18 November 2017
VARIATION IN THE PREVALENCE OF ROTAVIRUS GENOTYPES DURING FOUR YEARS OF SURVEILLANCE FROM AUGUST 2012 TO SEPTEMBER 2016 IN TURKEY
10th Balkan Congress of Microbiology, 16 - 18 November 2017
(P197) Evaluation of two-year blood culture profiles in a tertiary Hospital in Turkey: microorganisms and their antimicrobial susceptibility patterns.
10th Balkan Congress of Microbiology, Sofija, Bulgaria, 16 - 18 November 2017
Comparison of different dna extraction methods for detection of brucellosis in blood culture bottles
10.Balkan Congress of Microbiology, 16 - 18 November 2017
DIVERSITY ON THE PREVALENCE OF THE SPOLIGOTYPES OF MYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS ISOLATES IN TURKEY
10th Balkan Congress of Microbiology, 16 - 18 November 2017

Overview of the microbiology of tympanosclerotic plaque and cholesteatoma in the light of metagenomics research
10th Balkan Congress of Microbiology, 16 - 18 November 2017
TOWARDS MEASLES ELIMINATION: PHYLOGENETIC ANALYSIS OF MEASLES VIRUSES (2011-2015) IN TURKEY
10th Balkan Congress of Microbiology, 16 November 2017

Timpanosklerotik Plak ve Kolesteatom Mikrobiyotası: Metagenomiks Analiz
39. Türk Ulusal Kulak Burun Boğaz ve Baş Boyun Cerrahisi Kongresi, Turkey, 8 - 12 November 2017
Klinik örneklerden gerçek zamalı mültipleks polimeraz zincir reaksiyon yöntemiyle akut bakteriyel menenjit tanısı
4. Ulusal Klinik Mikrobiyoloji Kongresi, Turkey, 8 - 12 November 2017
Eskişehir’de 5 yaş altı çocuklarda rotavirus genotiplerinin belirlenmesi: 4 yıllık analiz sonuçları
20. Ulusal Parazitoloji Kongresi, 25 - 29 September 2017
Nail Scissorrs and fingernails as reservoirs of hepatitis B virus DNA:Role of nail scissors in household transmission of hepatitis B virus
20th ESCV 2017, 13 - 16 August 2017

Genotyping of Rotaviruses in pediatric patients with gastroenteritis by using real-time reverse transcription polymerase chain reaction.
19th International Conference on Medical Microbiology and Infection (ICMMI), 27 - 28 July 2017
Early Detection and Control of Methıcillin Resistant Staphylococcus aureus (MRSA) Outbreak in an Intensive Care Unit
ASM Microbe 2017 (American Society Microbiology) Congress, New Orleans, United States Of America, 1 - 05 June 2017
Molecular characterization of clinical Stenotrophomonas maltophilia isolates from a tertiary care hospital in Kayseri, Turkey.
27th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ECCMID), 22 - 25 April 2017
Neisseria meningitidis serogrup B aşı antijenlerinin genetik analizi MenB aşıları Türkiye izolatlarını kapsıyor mu
XXXVII. Türk Mikrobiyoloji Kongresi, Turkey, 16 - 20 November 2016

miRNA lar ve SiRNA lar
XXXVII. Türk Mikrobiyoloji Kongresi, Turkey, 16 - 20 November 2016
Türkiyede Rotavirus sürveyans ağı TÜROSA dört yıllık çalıma sonuçları
XXXVII. Türk Mikrobiyoloji Kongresi, Turkey, 16 - 20 November 2016
Karbapenem dirençli Pseudonomas aeroginosa klinik izolatlarında MexAB Oprm MexEF Oprn MexXY ve Oprd nin rolü
XXXVII. Türk Mikrobiyoloji Kongresi, Turkey, 16 - 20 November 2016
Türkiyede 2015 2016 Influenza sezonunda görülen Influenza A H1N1 PDMM09 virüsünün moleküler karakterizasyonu
XXXVII Türk Mikrobiyoloji Kongresi, Turkey, 16 - 20 November 2016
Rotavirus sürveyansı
3. Ulusal Klinik Mikrobiyoloji Kongresi, Turkey, 18 - 22 November 2015
Ulusal Tüberküloz Referans Laboratuvarında 2011 Yılı Ankara İli Surveyans Çalışması Kapsamında Tespit Edilen M tuberculosis Suşlarının Genotiplendirilmesi
Bulaşıcı Hastalıkların Laboratuvara Dayalı Sürveyans Sempozyumu, Nevşehir, Turkey, 18 - 19 September 2014
Enterokok Suşlarının Pulsed Field Gel Electrophoresis PFGE Yöntemiyle Moleküler Tiplendirilmesi
8. Ulusal Moleküler ve Tanısal Mikrobiyoloji Kongresi, Ankara, Turkey, 4 - 07 June 2014
Molecular Typing of Mycobacterium tuberculosis strains isolated during 2011 in Ankara, Turkey
33rd Annual Congress of European Society of Mycobacteriology, Brasov, Romania, 1 - 04 July 2012
Ulusal Tüberküloz Referans Laboratuvarı’nda 2008-2010 yılları arasında tespit edilen çoklu ilaç dirençli M. tuberculosis suşlarında Beijing genotipi
7. Ulusal Moleküler ve Tanısal Mikrobiyoloji Kongresi, Ankara, Turkey, 5 - 08 June 2012
(SS045) Ankara ilinde akciğer tüberkülozunda ilaç direnci taraması 2011 yılı ilk altı aylık veriler.
Türk Toraks Derneği 15. Yıllık Kongre, Antalya, Turkey, 11 - 15 April 2012
Multi drug Resistant Ratios of Mycobacterium Tuberculosis Complex Isolates Obtained From Pulmonary Samples Between 2003 and 2010 By Turkish National Tuberculosis Reference Laboratory
32nd Annual Congress of European Society of Mycobacteriology, Lübeck, Germany, 26 - 29 June 2011
2005-2010 Yıllarında Ulusal Tüberküloz Referans Laboratuvarında Akciğer Örneklerinden İzole Edilen M. tuberculosis Kompleks Suşlarının Çoklu Ve Yaygın İlaç Direnci Oranları Düzeyleri
XXVI. Göğüs hastalıkları ve Tüberküloz kongresi, Adana, Turkey, 23 - 26 March 2011
Ulusal tüberküloz referans laboratuvarı’nda 2010 yılında tespit edilen çoklu ilaç direnci M. tuberculosis suşlarının spoligotiplendirme sonuçları
XXVI. Göğüs hastalıkları ve Tüberküloz kongresi, Adana, Turkey, 23 - 26 March 2011
Books & Book Chapters
Tüberküloz Basillerinin Moleküler Tiplendirmesi: IS6110 RFLP, MIRU-VNTR ve Spoligotiplendirme
in: Moleküler Mikrobiyoloji: Tanı ve Epidemiyoloji, Durmaz Rıza, Eser Özgen, Otlu Barış, Editor, Akademisyen Yayınevi, Ankara, pp.513-520, 2022