Karbapenem dirençli MDR P. aeruginosa izolatlarında antibiyotik kombinasyonlarının in vitro etkileşimleri ile karbapenem direnç mekanizmaları arasındaki ilişki
Müderris T.(Yürütücü), Kaya S., Aksoy Gökmen A., Dal T., Açikgöz Z., Durmaz R.
Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, BAP Araştırma Projesi, 2020 - 2021
- Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
- Destek Programı: BAP Araştırma Projesi
- Başlama Tarihi: Mart 2020
- Bitiş Tarihi: Mart 2021
Proje Özeti
Son yıllarda Pseudomonas aeruginosa izolatları arasında karbapenem direnci giderek artmaktadır. Bu izolatlar genellikle çoklu ilaç direncine (MDR) sahiptir. Bu enfeksiyonların tedavisi zordur ve mortalite ve morbiditenin artmasına yol açmaktadır. Karbepenem direnci genellikle birden fazla mekanizmanın birlikteliği sonucunda ortaya çıkmaktadır. Yapılan in vitro çalışmalar, bakterinin tek başına bir antibiyotiğe dirençli olsa bile antibiyotik kombinasyonlarının tedavide etkili olabileceğini desteklemektedir. Kombine antibiyotik tedavileri ilaçların toksisitesini azaltacağı gibi antibiyotik direnç gelişimini de engeller. Bu ilaç kombinasyonlarının doğru seçilebilmesi için antibiyotiklerin sinerjistik etkilerinin iyi anlaşılması gerekmektedir. Biz de bu proje ile karbapenem dirençli P. aeruginosa izolatlarında karbapenem direnç mekanizmalarını araştırmayı ve tedavide kullanılabilecek çeşitli antibiyotik kombinasyonlarının in-vitro etkileşimlerini belirlemeyi ve antibiyotik kombinasyonlarının in-vitro etkileşimleri ile karbapenem direnç mekanizmaları arasındaki ilişkiyi göstermeyi amaçladık. Projemizin başka bir amacı da karbapenemlere dirençli izolatlarda antibiyotik sinerji testlerinden E test ve dama tahtası metodlarının karşılaştırılmasıdır.Bu proje Yıldırım Beyazıt Üniversitesi bilimsel araştırma projeleri tarafından desteklenen ‘Role of efflux pump and OprD porin expression in carbapenem resistance of Pseudomonas aeruginosa clinical isolates’ isimli araştırmamızı tamamlayıcı bir projedir. Projede karbapenem dirençli olan ve önceden OprD porin downregülasyonu, MexAB-OprM, MexCD–OprJ, MexXY-OprM efflux pompa overekspresyonu, karbapenemaz varlığı yönünden araştırılmış ve PFGE ile klonal ilişkileri belirlenmiş MDR P. aeruginosa izolatları kullanılacaktır. İlk aşamada, bu izolatlarda diğer karbapenem direnç mekanizmaları araştırılacaktır. Bu aşama oprD porin geninin sekanslanması ve mutasyonlarının belirlenmesini, MexEF–OprN aktif pompa overekspresyonunun belirlenmesini ve kromozomal AmpC β-laktamaz overekspresyonu ve genişletilmiş spektrum AmpC sefalosporinaz (ESACs) varlığının belirlenmesini içermektedir. İkinci aşama ise bu izolatlarda antibiyotik kombinasyonlarının (fosfomisin-kolistin, fosfomisin-ertapenem ve meropenem-ertapenem) in-vitro etkileşimlerinin E test ve dama tahtası metodları ile belirlenmesini ve bu iki yöntemin karşılaştırılmasını içermektedir. Böylece dirençli P. aeruginosa enfeksiyonlarının kontrolü ve direnç gelişiminin engellenmesine yönelik yeni startejilerin geliştirilmesine katkı sağlanacaktır. Projemiz bu enfeksiyonların tedavisinde yeni tedavi protokollerinin oluşturulması için yol gösterici olacaktır.