Biography
1998 yılında Hacettepe Üniversitesi Fen Fakültesi Biyoloji Bölümünden mezun olmuştur. 2002 yılında Orta Doğu Teknik Üniversitesi Biyoloji Bölümü Biyokimya Anabilim Dalında Yüksek Lisans Eğitimini tamamlamıştır. 2008 yılında Sabancı Üniversitesi Mühendislik ve Doğa Bilimleri Fakültesi Biyolojik Bilimler ve Biyomühendislik Bölümünden Doktora Eğitimini tamamlamıştır. 2011-2013 yılları arasında İzmir Yüksek Teknoloji Enstitüsü Fen Fakültesi Kimya bölümünde Öğretim Görevlisi olarak Görev yapmıştır. 2014-2018 yılları arasında kurumda idari personel olarak görev almış 2018 yılından itibaren Dr. Öğretim Üyesi olarak çalışmaya devam etmektedir. Filiz YEŞİLIRMAK'ın biyofizik, proteomiks ve protein üç boyutlu yapısı konularında ulusal ve uluslararası alanda yayınlanmış araştırmaları bulunmaktadır.
Education
2003 - 2008
2003 - 2008Doctorate
Sabanci University, Instıtute Of Scıence, Biyoloji Bilimleri Ve Biyomühendislik (Dr), Turkey
1999 - 2002
1999 - 2002Postgraduate
Middle East Technical University, Faculty Of Arts And Sciences, Department Of Biology, Turkey
1994 - 1998
1994 - 1998Undergraduate
Hacettepe University, Fen Fakültesi, Biyoloji Bölümü, Turkey
Dissertations
2008
2008Doctorate
Biophysical and functional characterization of wheat metallothionein at molecular level
Sabancı Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Biyoloji Bilimleri Ve Biyomühendislik (Dr)
2002
2002Postgraduate
PCR-based typing studies on Lactobacillus plantarum strains
Orta Doğu Teknik Üniversitesi, Türk Halkoyunları, Biyokimya (Yl) (Tezli)
Research Areas
Research Areas Based on Academic Activities
Avesis Research Areas
WoS Research Areas
Scopus Research Areas
Academic Positions
2021 - Continues
2021 - ContinuesAssistant Professor
Ankara Yildirim Beyazit University, Sağlık Bilimleri Fakültesi, Hemşirelik
2018 - 2021
2018 - 2021Assistant Professor
Ankara Yildirim Beyazit University, Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu, Tıbbi Hizmetler ve Teknikler Bölümü
2011 - 2013
2011 - 2013Lecturer
Izmir Institute Of Technology, Faculty Of Scıence, Department Of Chemıstry (Englısh)
2008 - 2010
2008 - 2010Expert
Sabanci University, Faculty Of Engıneerıng And Natural Scıences
Managerial Experience
2019 - 2021
2019 - 2021Head of Department
Ankara Yildirim Beyazit University, Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu, Tıbbi Hizmetler ve Teknikler Bölümü
2019 - 2020
2019 - 2020Assistant Director of Vocational School
Ankara Yildirim Beyazit University, Sağlık Hizmetleri Meslek Yüksekokulu, Tıbbi Hizmetler ve Teknikler Bölümü
2018 - 2019
2018 - 2019BAP Coordinator
Ankara Yildirim Beyazit University
Articles
2024
20241. A proteomic study to elucidate molecular relationships between iron, oxidative stress and polyphosphate in Streptomyces coelicolor A3(2)
Yilmaz Ş., YEŞİLIRMAK F., Tunca S.
Biologia , vol.79, no.9, pp.2917-2931, 2024 (SCI-Expanded, Scopus)
2024
20242. PROTEOMIC ANALYSIS OF CADMIUM RESPONSIVE PROTEINS IN WHEAT
YEŞİLIRMAK F.
Hacettepe Journal of Biology and Chemistry , vol.52, no.3, pp.181-188, 2024 (TRDizin)
2023
20233. Beslenme ve Epigenetik
YEŞİLIRMAK F.
Türkiye Sağlık Bilimleri ve Araştırmaları Dergisi , vol.6, no.3, pp.104-120, 2023 (Peer-Reviewed Journal)
2018
20184. Comparative proteomic analysis of bacillus thuringiensis wild-type and two mutant strains disturbed in polyphosphate homeostasis
Yeşilirmak F., Doruk T., Yilmaz Ş., Tunca Gedik S.
Turkish Journal of Biology
, vol.42, no.1, pp.87-102, 2018 (SCI-Expanded, Scopus, TRDizin)
2017
20175. Functional Analysis of Triticum durum Type 1 Metallothionein Gene (mt-d) in Response to Varying Levels of Cadmium
YEŞİLIRMAK F., ÖZTÜRK GÖKÇE Z. N., METİN B., SAYERS Z.
Indian Journal of Plant Physiology , vol.23, no.1, pp.140-147, 2017 (Scopus)
2009
20096. Heterelogous Expression of Plant Genes
YEŞİLIRMAK F., SAYERS Z.
International Journal of Plant Genomics
, 2009 (Scopus)
Papers Presented at Peer-Reviewed Scientific Conferences
2024
20241. NUTRITION IN OMIC ERA
YEŞİLIRMAK F.
3RD INTERNATIONAL IZMIR CONGRESS ON MEDICINE, NURSING, MIDWIFERY, AND HEALTH SCIENCES, Turkey, 14 - 16 February 2024, pp.550, (Summary Text)
2018
20182. Effect of Cadmium on expression of Metallothionein Gene in durum wheat
YEŞİLIRMAK F., METİN B., SAYERS Z.
I. Uluslararası Bitki Biyolojisi Kongresi, 10 - 12 May 2018, (Summary Text)
2015
20153. Bacillus thuringiensis’te polifosfat metabolizması ve ikincil metabolit üretimi arasındaki ilişki.
DORUK T., YILMAZ Ş., YEŞİLIRMAK F., TUNCA GEDİK S.
18. Biyoteknoloji Kongresi, Turkey, 18 - 19 December 2015, (Summary Text)
2014
20144. Endotoksin biosynthesis and polyphosphate metabolism in Bacillus thuringiensis
YEŞİLIRMAK F., DORUK T., TUNCA GEDİK S.
International Conference on Biopesticides 7 (ICOB), 19 - 25 October 2014, (Summary Text)
2013
20135. Comparative Characterization of Apo-, Reconstituted- and in vivo-Folded forms of a durum Wheat Metallothionein.
SAYERS Z., YEŞİLIRMAK F.
Biophysical Society 57nd Annual Meeting, 2 - 06 February 2013, vol.104, pp.396, (Summary Text)
2009
20096. Structural Studies on Mutant Wheat Metallothioneins
SAYGI C., AKTÜRK A., AYDIN M., YEŞİLIRMAK F., SAYERS Z.
25. European Crystallographic Meeting, 16 - 21 August 2009, (Summary Text)
2009
20097. Purification and Structural Analysis of Durum Wheat Metallothionein Domains.
KISAAYAK ÇOLLAK F., YEŞİLIRMAK F., DİNLER DOĞANAY G., SAYERS Z.
25th European Crystallographic Meeting, 16 - 21 August 2009, (Summary Text)
2009
20098. Use of Modified Metallothioneins for Biosensor Application.
YEŞİLIRMAK F., SAYERS Z.
25. European Crystallographic Meeting, 16 - 21 August 2009, (Summary Text)
2009
20099. Structural and metal-binding studies on a Triticum durum metallothionein and its mutants,
SAYERS Z., KISAAYAK ÇOLLAK F., YEŞİLIRMAK F., DİNLER DOĞANAY G.
2nd Georgian Bay International Conference on Bioinorganic Chemistry, 26 - 29 May 2009, (Summary Text)
2009
200910. Investigation of structural features of mutant Metallothioneins: Modifications in Cysteine Motifs of T. durum Metallothionein.
SAYGI C., AYDIN M., YEŞİLIRMAK F., SAYERS Z.
14. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı, Turkey, 20 - 24 May 2009, (Full Text)
2009
200911. Investigation of structural features of mutant Metallothioneins I: Hingeless T. durum metallothionein.
AKTÜRK A., YEŞİLIRMAK F., SAYERS Z.
14. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı, Turkey, 20 - 24 May 2009, (Full Text)
2009
200912. Biophysical Characterization of recombinant Metallothionein and Its possible uses as a Biosensor.
YEŞİLIRMAK F., SAYERS Z.
14. Biyomedikal Mühendisliği Ulusal Toplantısı, Turkey, 20 - 24 May 2009, (Full Text)
2008
200813. Proteinin Kromatografik Yöntemler ile Karakterizasyonu.
YEŞİLIRMAK F., SAYERS Z.
Kromatografi 2008 Kongresi, Turkey, 9 - 11 June 2008, (Summary Text)
2008
200814. GSTdMT: A Model for structural and functional studies of durum metallothionein.
YEŞİLIRMAK F., SAYERS Z.
EMBO Genç Bilim Adamları Forumu, Turkey, 20 - 22 February 2008, (Summary Text)
2008
200815. Structural study of Triticum durum metallothionein.
YAR S., DİNLER DOĞANAY G., YEŞİLIRMAK F., SAYERS Z.
EMBO Genç Bilim Adamları Forumu, Turkey, 20 - 22 February 2008, (Summary Text)
2008
200816. Purification and Characterization of Recombinant durum Metallothionein Domain Constructs.
KISAAYAK ÇOLLAK F., DİNLER DOĞANAY G., YEŞİLIRMAK F., SAYERS Z.
Biophysical Society 52nd Annual Meeting, 16th IUPAB International Biophysics Congress., 2 - 06 February 2008, vol.94, pp.902-911, (Summary Text)
2008
200817. Plant Type 1 Metallothioneins: Candidates for Intrinsically Unstructured Proteins.
DİNLER DOĞANAY G., YEŞİLIRMAK F., Yar S., KISAAYAK ÇOLLAK F., SAYERS Z.
Biophysical Society 52nd Annual Meeting, 16th IUPAB International Biophysics Congress., 2 - 06 February 2008, vol.94, pp.911-918, (Summary Text)
2008
200818. Characterization of Recombinant durum Metallothionein and Implications for the Native Protein
YEŞİLIRMAK F., DİNLER DOĞANAY G., KISAAYAK ÇOLLAK F., SAYERS Z.
Biophysical Society 52nd Annual Meeting, 16th IUPAB International Biophysics Congress, 2 - 06 February 2008, vol.94, pp.364-368, (Summary Text)
2007
200719. Are Plant Type-1 Metallothioneins Possible Candidates for Intrinsically Unstructured Proteins?
DİNLER DOĞANAY G., YEŞİLIRMAK F., KISAAYAK ÇOLLAK F., SAYERS Z.
6th SESAME Users’ Meeting, 17 - 19 November 2007, (Summary Text)
2007
200720. Purification and Structural Characterization of Constructs of Metal-Binding domains of Durum Wheat Metallothionein
KISAAYAK ÇOLLAK F., DİNLER DOĞANAY G., YEŞİLIRMAK F., SAYERS Z.
6th SESAME Users’ Meeting, 17 - 19 November 2007, (Summary Text)
2007
200721. Characterization of Recombinant Metallothionein from Triticum durum wheat.
YEŞİLIRMAK F., DİNLER DOĞANAY G., SAYERS Z.
6th SESAME Users’ Meeting, 17 - 19 November 2007, (Summary Text)
2007
200722. Functional and structural investigations of a metallothionein from durum wheat, dMT,
DİNLER DOĞANAY G., YEŞİLIRMAK F., KISAAYAK ÇOLLAK F., SAYERS Z.
Protein Society 21st Symposium, 21 - 25 July 2007, (Summary Text)
2006
200623. Structural Investigations of Metallothionein from Triticum durum wheat.
DİNLER DOĞANAY G., YEŞİLIRMAK F., KISAAYAK ÇOLLAK F., SAYERS Z.
5th SESAME Users’ Meeting, 27 - 29 November 2006, (Summary Text)
2006
200624. Structural and Functional Investigations of Metallothionein from Triticum durum wheat.
YEŞİLIRMAK F., TUNCA GEDİK S., SAYERS Z.
PROTEOMİK: Protein Yapısı ve Fonksiyonu Çalıştayı, Turkey, 20 - 23 October 2006, (Summary Text)
2005
200525. Structural Studies of Metallothionein protein of Triticum durum
YEŞİLIRMAK F., BİLECEN K., TUNCA GEDİK S., SAYERS Z.
FEBS 30 FEBS 30TH CONGRESS/ CONGRESS/9TH IUBMB CONFERENCE IUBMB CONFERENCE, 2 - 07 July 2005, vol.272, pp.348-407, (Summary Text)
Books
2023
20231. Nutrition and Epigenetic
YEŞİLIRMAK F.
in: Türkiye Sağlık Bilimleri ve Araştırmaları Dergisi, , Editor, Türkiye Sağlık Bilimleri ve Araştırmaları Dergisi, Ankara, pp.104-120, 2023
2023
20232. Beslenme Araştırmalarında Proteomik: İlkeler, Teknolojiler Ve Uygulamalar
YEŞİLIRMAK F.
in: Sağlık Bilimlerinde Yenilikçi Çalışmalar, Doç. Dr. Sadettin DEMİREL, Editor, duvar, pp.511-539, 2023
2015
20153. Lucilia sericata: Morfoloji ve Biyolojisi
YEŞİLIRMAK F., ÇARHAN A.
in: Multidisipliner Yaklaşımlı Biyolojik Temelli Doğal Tedaviler- Biyoterapi, Tanyüksel Mehmet, Mumcuoğlu Kosta, Editor, Parazitoloji Derneği, pp.369-374, 2015
2015
20154. Lucia Sericata: Morfoloji ve Biyolojisi
ÇARHAN A., Yeşilırmak F.
in: Multidisipliner Yaklaşımlı Biyolojik Temelli Doğal Tedaviler Biyoterapi, Prof.Dr. Mehmet Tanyüksel, Prof. Dr. Kosta Y.Mumcuoğlu, Editor, Türkiye Parazitoloji Derneği, pp.369-374, 2015
2007
2007